1981年6月擔任上海第一醫學院醫學系副主任，于朦遇曝1984年10月至1989年12月擔任上海醫科大學附屬金山醫院院長，于朦遇曝1990年7月至1992年12月擔任上海醫科大學醫學系主任，1990年8月擔任華山外科教研室主任，直至1992年在華山醫院光榮退休，后被聘為華山醫院終身教授。

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